2015-10-22
出访任务
| 赴美国农业部USDA-ARS执行国家外专局项目“美国深度测序技术的引进及在马铃薯质检中的应用”(项目编号:P152011004)和哈尔滨市科技局国际合作项目“利用深度测序(small RNA deep sequencing)技术鉴定马铃薯主要病毒及类病毒的研究与应用”项目中的国际交流费(项目编号:2013AE6AW059)。
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出访国家或地区 及停留天数
| 美国,在外停留365天
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出访人员基本情况
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姓名
| 工作单位
| 职务/职称
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邱彩玲
| 2024澳门原料网1688植物脱毒苗木研究所
| 科员/助理研究员
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邀请函(别附)或 邀请单位情况介绍
| 美国农业部USDA-ARS拥有大批来自世界各地的科研精英,掌握并引领着世界前沿的科技发展方向,具有多年从事本领域的工作基础和经验,拥有成熟的配套实验设施和完善的技术体系,该研究中心与项目申请单位具有良好的合作基础和合作愿望,该机构愿意为本项目的实施提供支持。
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经费来源
| 境外费用由国家外专局承担,往返国际费用由2024澳门原料网1688植物脱毒苗木研究所承担的哈尔滨市科技局国际合作项目“利用深度测序(small RNA deep sequencing)技术鉴定马铃薯主要病毒及类病毒的研究与应用”承担(项目编号:2013AE6AW059),该项目国际交流费9万元,足够支付此次出访。
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日程安排如下
2015.12.31
| UA088,北京至纽瓦克17:00起飞, 17:50抵达 UA4370,纽瓦克至查尔斯顿,20:02起飞 22:09 抵达
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2016.1.1-2016.1.10
| 熟悉实验室环境及人员,学习实验室的规章制度,阅读培训资料,制定培训计划。
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2016.1.11-2016.1.22
| 阅读深度测序技术相关文献和书籍,学习深度测序技术的几种方法的原理和应用,尤其是在马铃薯病毒、类病毒检测方面的应用。
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2016.1.23-2016.2.10
| 学习利用小RNA深度测序技术鉴定马铃薯病毒、类病毒的试验原理、思路和技术流程,设计试验方案并讨论其可行性、修改方案。
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2016.2.11-2016.3.1
| 学习植物小RNA提取的原理、文库构建方法;马铃薯样品的选择要点,马铃薯样品的取样和保存样品的方法并实际操作。
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2016.3.2-2016.3.16
| 学习深度测序基本分析方法,包括去街头,去污染等数据预处理技术,并学习序列组装方法和数据质量控制程序。
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2016.3.17-2016.4.2
| 学习小RNA测序技术和不同测序平台的异同,掌握测序平台选择的主要依据,学会应用不同的测序平台解决工作中出现的问题。
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2016.4.3-2016.4.30
| 学习利用深度测序技术测定已知和未知马铃薯病毒、类病毒的分析方法,准备试验材料。
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2016.5.1-2016.6.1
| 试验材料培养;学习深度测序相关分析软件的原理和使用方法。
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2016.6.2-2016.6.16
| 对培养的试验材料进行小RNA提取,质量检测,待小RNA质量合格后进行深度测序。
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2016.6.17-2016.8.11
| 对测序结果进行预处理,去街头和污染等,并进行丰度分析、热点分析;组装Contigs, 并用组装的Contigs以及reads进行BLAST分析,组装马铃薯病毒和类病毒。
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2016.8.12-2016.9.20
| 对检测到的马铃薯病原进行RT-PCR扩增,补充Gap,扩增全序列并测序,同时准备指示植物用于下一步接种鉴定。
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2016.9.21-2016.12.10
| 利用检测到的病原制备侵染性克隆,利用制备的侵染性克隆对指示植物接种鉴定,用常规方法检测接种结果,并观察、记录、统计症状表现。
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2016.12.28
| 查尔斯顿——华盛顿——北京( UA3714,UA807)
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2016.12.29
| 抵达北京
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特此公示。公示期为2015年10月19日—10月26日,若有异议,请以书面形式于2015年10月26日前向外事处反映。
联 系 人:唐晓东
联系电话:0451-86677452 [email protected]
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